内蒙古大学的创办是在周恩来总理的亲切关怀和高教部、自治区党委政府直接领导下进行的。当时，鉴于建国后内蒙古自治区建成和在建的高校已经有３所，同时由于国家建设资金紧张，高教部批复暂不同意创办内蒙古大学。周恩来总理得知情况后，明确指示高教部，要帮助少数民族地区发展经济和文化教育事业。高教部遵照总理指示，很快批准了自治区党委和人民委员会关于创办内蒙古大学的申请报告，并积极支持内蒙古大学的筹建，委派高等教育部综合大学司副司长于北辰参加筹建工作，协助进行学校的建筑设计、施工和师资调配工作。

    １９５６年３月１６日，自治区人民委员会第十二次会议通过决议，成立内蒙古大学筹备委员会，自治区主席乌兰夫任筹委会主任。内蒙古大学筹委会的建立引起了社会各界的关注，《人民日报》等新闻媒体都进行报道。１９５７年１０月１４日，内蒙古大学举行了隆重的建校典礼。乌兰夫兼任内蒙古大学首任校长，于北辰任副校长，中国科学院学部委员、著名生物学家、北京大学教授李继侗于建校初期来校执教并担任副校长。

    １９５７年秋季，内蒙古大学招收了第一届学生３４０名。初创时的内蒙古大学开设６个系、８个专业，主要开展本科教育。建校初期，周恩来总理指示高教部从北京大学、南开大学、复旦大学、厦门大学等１２所国内著名高校抽调了一大批优秀教师到内蒙古大学任教，组成了最初的师资队伍，教学人员１５２人，其中教授和副教授７人，讲师２０人，助教９２人，教辅人员３３名。

    ５０年来，内蒙古大学各项事业蓬勃发展，取得了令人瞩目的成绩。目前，学校设有１５个学院和１个公共教学部，学院所属３４个系，有５９个本科专业，９２个硕士学位授权点，３个博士后流动站，教师和科研人员近４０００名。实现了从普通高校到全国重点大学，从一般性建设到“２１１工程”重点建设，从地方性大学到省（区）部共建大学这样三次历史性跨越，为国家和自治区培养各类人才４万余名。